myisamchk
Проверка и исправление ошибок в MyIsam базах.
mysql/db # myisamchk --silent --force --fast --update-state -O key_buffer=64M -O sort_buffer=64M -O read_buffer=1M -O write_buffer=1M ./*/*.MYI
На время проверки mysqld лучше остановить, или делать проверку через REPAIR из mysql монитора.

